Plus d'une décennie après avoir foulé pour la première fois le sol de Pandora, Jake Sully est désormais considéré comme un membre à part entière du peuple des Na'vis, les paisibles habitants de cette exolune de Polyphème. Auprès de sa compagne Neytiri et de leurs enfants, l'ancien soldat profite d'une existence en tous points idyllique. Mais cette belle harmonie est soudainement brisée en raison d'un conflit latent et insoluble qui finit par se transformer en une véritable guerre. La petite famille se voit contrainte d'abandonner son foyer pour partir explorer les contrées inconnues de Pandora à la recherche d'un havre de paix...